La Morte di Minato

Dopo aver eliminato i ninja nemici travestiti da ninja della Pietra Nascosta per attaccare i ninja della Foglia Nascosta posizionati ai margini del villaggio, Kakashi apprende da Minato che vorrebbe che lui aiutasse a proteggere Kushina durante il travaglio, quando il sigillo che trattiene Kurama è più debole. Assumendo diligentemente la missione, Kakashi va alla tomba di Rin per informarla del nuovo sviluppo. Tuttavia, Kakashi ignora che Obito ha sentito tutto, portando l'uomo mascherato a scatenare la Nove Code sul villaggio prima che essa venga sigillata nel neonato Naruto Uzumaki, al costo della vita di Minato e Kushina. Promettendo alla morente Kushina che proteggerà il figlio del suo successore, Hiruzen riprende i suoi doveri come Terzo Hokage fino a quando un altro successore non sarà preparato per il ruolo. Poco dopo, Danzo persuade Kakashi a unirsi a Root mentre incontra un altro membro degli ANBU di nome Kinoe che possiede lo Stile Legno.