集數 1-14
第五研究所篇
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安心閱讀《鋼之鍊金術師 BROTHERHOOD》講述兄弟愛德華與阿爾馮斯·艾力克試圖用鍊金術復活已故的母親，卻招致災難性的後果：阿爾失去了身體，愛德失去了左腿。愛德又以自己的手臂作為代價，將阿爾的靈魂綁定到一副鎧甲上。兄弟倆成為國家鍊金術師，尋找賢者之石，希望能夠恢復他們的身體，卻逐步揭開涉及人造人（Homunculi）的巨大政府陰謀——那是透過禁忌鍊金術創造出來的人工生命。
完整劇情摘要
劇透《鋼之鍊金術師 BROTHERHOOD》的故事發生在由軍方統治的亞美斯多利斯國。兄弟愛德華與阿爾馮斯·艾力克為了復活已故的母親崔莎，嘗試了被禁止的人體煉成。實驗以災難性的失敗告終：阿爾的身體完全消失，愛德失去了左腿。走投無路之下，愛德犧牲自己的右臂，將阿爾的靈魂綁定到一副鎧甲上。他們從溫莉和皮納可那裡得到機械鎧義肢，並下定決心燒毀了自己的家。兄弟倆前往首都，成為國家鍊金術師，而愛德則被稱為「鋼之鍊金術師」。在羅伊·馬斯坦古上校的指示下，他們尋找能夠繞過等價交換的賢者之石。之後他們發現，賢者之石是由人命製成的，而人造人則是父親實驗的產物。父親是一個拒絕神明的存在，他計畫製造一個全國性的煉成陣，在阿爾卡海斯特時吸收亞美斯多利斯全體人類的力量。系列最終在中央市的戰鬥中迎來高潮，父親的目的被阻止，瓶中小人被消滅，布拉德雷國王也被揭露為憤怒。愛德透過真理之門放棄了使用鍊金術的能力，以換回阿爾的身體。兄弟倆回到瑞賽布爾，系列結束時愛德去探望溫莉。
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Story Arcs
7 entries集數指南
64 / 64 entries 1 盲眼的鍊金術士 Canon 2 普通的人們 Canon 3 老師的故事 Canon 4 又一個男人的戰場 Canon 5 悲傷的雨 Canon 6 希望之路 Canon 7 隱藏的真相 Canon 8 第五實驗室 Canon 9 創造的感情 Canon 10 分開的目的地 Canon 11 急流谷的奇蹟 Canon 12 一即是全，全即是一 Canon 13 達布利斯的野獸 Canon 14 潛伏在地下的人們 Canon 15 來自東方的使者 Canon 16 戰友的腳步聲 Canon 17 冷火焰 Canon 18 小人類的傲慢掌心 Canon 19 不死者之死 Canon 20 墳墓前的父親 Canon 21 愚者的前進 Canon 22 遠方的背影 Canon 23 戰場上的少女 Canon 24 腹部裡面 Canon 25 黑暗之門 Canon 26 重聚 Canon 27 插曲派對 Canon 28 父親 Canon 29 愚人的鬥爭 Canon 30 伊什瓦爾滅絕戰爭 Canon 31 520 Cens的承諾 Canon 32 元首之子 Canon 33 布里格斯的北牆 Canon 34 冰之女王 Canon 35 這個國家的形狀 Canon 36 全家福 Canon 37 第一個人工生命體 Canon 38 巴斯库尔的衝突 Canon 39 白日夢 Canon 40 人造人（試管裡的侏儒） Canon 41 深淵 Canon 42 反攻的徵兆 Canon 43 蟻咬 Canon 44 全速前进 Canon 45 承諾之日 Canon 46 潛伏的陰影 Canon 47 黑暗使者 Canon 48 隧道中的誓言 Canon 49 孝順之情 Canon 50 中央的動亂 Canon 51 不朽軍團 Canon 52 合力 Canon 53 復仇之火 Canon 54 超越地獄 Canon 55 成年人的生活方式 Canon 56 元首的歸來 Canon 57 永恆的休假 Canon 58 犧牲 Canon 59 失落之光 Canon 60 天之眼，地之門 Canon 61 那個想要吞噬神的人 Canon 62 激烈的反擊戰 Canon 63 閘門的另一邊 Canon 64 旅程的終點 Canon
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Alphonse Elric main 
Edward Elric main 
Roy Mustang main 
Izumi Curtis supporting 
Ling Yao supporting 
Maes Hughes supporting 
May Chang supporting 
Pinako Rockbell supporting 
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Envy antagonist 
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Gluttony antagonist 
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Sloth antagonist