Origine del Dolore

Nagato continua a parlare con Naruto e descrive il suo secondo Pain, come lui e Konan hanno aiutato Yahiko a utilizzare ciò che avevano imparato da Jiraiya per creare l'Akatsuki e portare la pace al Villaggio della Pioggia Nascosta. Ma Hanzo ha considerato il gruppo di Yahiko una minaccia per il suo regime e si è alleato con Danzo per rapire Konan. Hanzo ordina a Nagato di uccidere Yahiko se vuole che lei viva e Yahiko si sacrifica per Konan, suscitando orrore in Nagato e costringendolo allo stato e alla condizione mentale invalida in cui si trova oggi.