Ang Super Lihim na Misyon ng Ranggo S

Sinimulan ni Naruto ang kanyang top secret na misyon na S-rank bilang tagasuri ng hayop, na hindi pa niya alam na ito pala ay isang distraksyon upang itago sa kanya ang paparating na digmaan habang ang isla mismo ay ipinapakita bilang isang dambuhalang pagong. Ang tungkulin ni Naruto na ilagay ang mga hayop sa isang silungan ay nagdulot sa kanya na makatagpo ng isang pasaherong kondor at masangkot sa alitan ng mga dambuhalang hayop na nahulog sa isang dambuhalang armadillo. Sa taguan ng Akatsuki, inilantad ni Kabuto ang kanyang nalalaman tungkol sa Project Tsuki no Mi at ang kanyang hangaring magsagawa ng eksperimento kay Zetsu habang pinipilit si Tobi na payagan siyang habulin ang mga jinchuriki at si Yamato. Tinanggap ni Tobi ang proposisyon, dinala si Kabuto sa isang silid kung saan ang Estatwa ng Gedo ay nakapatong sa isang bulaklak na may walang malay na klon ng katawan ni Hashirama Senju na pinagsama rito. Ipinakita ni Tobi na ang mga ugat ng bulaklak ay naglalaman ng isang armya ng 100,000 White Zetsu na nilikha mula sa chakra ng mga bihag na tailed beasts na handa nang ipadala. Nang malaman ng limang Kage na nalalaman na ngayon ng Akatsuki ang kinaroroonan ng mga jinchuriki, inalok ni Onoki na maglakbay patungo sa isla kasama ang kanyang mga bodyguard. Naharang ni Onoki sina Kabuto at ang binuhay na si Deidara sa daan.