Ang Misteryo ni Tobi

Nagpapatuloy ang mga ninja ng Leaf sa pakikipaglaban kay Tobi, ngunit ang lahat ng kanilang mga atake ay dumaraan sa kanya. Nahuli ni Shino si Tobi gamit ang beetle sphere pero ginamit ni Tobi ang teleportation jutsu para makatakas. Dumating si Zetsu upang ipaalam kay Tobi ang kinalabasan ng laban ng mga Uchiha, na narinig ng mga ninja ng Leaf. Napawalang-bisa ni Madara ang kanyang pagpapanggap at iniwan ang labanan; ipinakita niya ang kanyang Sharingan at kinalap ang mga bangkay ng magkapatid. Nagising si Sasuke sa isang kuweba at nilapitan siya ni Madara, ipinakilala ang sarili. Inilabas ni Sasuke ang Amaterasu mula sa kanyang mata ngunit gumaling si Madara mula rito at sinabi kung gaano kalalim ang plano ni Itachi. Tinanong ni Sasuke kung ano ang ibig sabihin nito, at sinabi ni Madara na sinusubukan ni Itachi na protektahan siya.