Tornare al presente! Vent'anni dopo!

Bonney esplora i ricordi di suo padre, assistendo ai traumi della sua infanzia. Nel frattempo, il caos esplode nel laboratorio a causa di un'esplosione che interrompe le comunicazioni e disabilita le misure di sicurezza. Luffy e Shaka si rendono conto che qualcuno sta causando problemi. Il resto dei Cappello di Paglia continua a cercare il Dottor Vegapunk. Il gruppo di Usopp trova Pythagoras danneggiato dall'esplosione, mentre S-Snake pietrifica York.