Die Neue Akatsuki

Yahiko offenbart Nagato seine Absicht, als Anführer der Akatsuki zurückzutreten, und bittet seinen Freund, seinen Platz einzunehmen, ohne zu wissen, dass Konan gefangen genommen wurde. Währenddessen werden sie von einem verkleideten Danzo angesprochen, der ihnen mitteilt, dass Hanzo sie treffen möchte. Bevor sie aufbrechen, wird Nagato von Obito gewarnt, sich auf die Realität vorzubereiten, falls er sich weigert, seine Freunde aufzugeben. Nachdem Nagato und Yahiko gegangen sind, erhält Kyusuke einen Brief, dass auch die ANBU der Blätter Hanzo treffen, und erkennt, dass es eine Falle ist. Kyusuke und die anderen Mitglieder der Akatsuki versuchen, Yahiko und Nagato einzuholen, werden jedoch von Obito und Zetsu abgefangen und getötet, wobei Obito möchte, dass Nagato dieselbe Tragödie erlebt, die er beim Tod von Rin erfahren hat. Die beiden erreichen den Treffpunkt mit Hanzo und werden Zeugen, wie Yahiko sich durch Nagatos Kunai sticht, während Hanzo Nagato zwingt, zwischen seinem Tod und Konans Leben zu wählen. Wütend und schwer verletzt durch Klebepapierbomben, die seine Beine stark beschädigen, nutzt Nagato seinen Rinnegan und die Gedo-Statue, um die Shinobi der Blätter und des Regens zu töten, während Hanzo und Danzo entkommen. Kurz nachdem Nagato Obito trifft und dessen Ideale angenommen hat, verwandelt er Yahikos Leiche in den Deva-Pfad seiner Sechs Pfade des Schmerzes, damit Yahiko weiterhin Anführer der Akatsuki bleibt.